O estudo Desafios dos Municípios 2021 demonstra que Florianópolis lidera ranking com a melhor saúde em relação aos 100 maiores municípios do país. Além da saúde, o levantamento avalia as áreas da educação, de segurança e de saneamento e sustentabilidade. No geral, a capital aparece em 21º no Índice dos Desafios da Gestão Municipal (IDGM), que compara as 100 cidades e analisa dados de 2009 a 2019. Nesse período, a cidade se manteve em primeiro na área da saúde e subiu em segurança, porém, caiu em educação e saneamento.
Na saúde, a taxa de mortalidade infantil em Florianópolis foi um dos indicadores analisados. A cidade tem uma taxa de 5,4 por mil nascidos vivos em 2019, menor que a média dos 100 maiores municípios do país. A análise feita em 10 anos, entre 2009 e 2019, demonstra que a taxa de mortalidade caiu 40%, passando de 47 para 33 óbitos. A capital ainda conta com 91,7% de cobertura das equipes na atenção básica. Ao todo, são 445.290 pessoas cobertas pelas equipes de atenção primária.
Nas outras áreas, o município aparece em 19ª na segurança, 39ª na educação e 56ª em saneamento e sustentabilidade. Na última década, a cidade melhorou a posição no ranking em segurança, subindo 9 posições. Entretanto, perdeu na área da educação (-22 posições) e saneamento e sustentabilidade (-11 posições). Na área da saúde, Florianópolis permanece na primeira colocação do ranking.
