O balanço semestral de estatísticas da Secretaria de Estado da Segurança Pública de Santa Catarina mostra que houve queda significativa nos índices de criminalidade em São José. Os dados, colhidos até 14 de junho de 2019, indicam que o município apresentou queda de 73,23% das ocorrências de furto, além da diminuição de 65,92% dos registros roubo e 25% nos casos de homicídio.
Em 2018, a GMSJ registrou um total de 15.699 ocorrências atendidas. Neste período, foram recuperados 91 veículos, sendo que, desses, oito haviam sido clonados. Os guardas municipais também retiraram de circulação armas e munições de calibre 38 e 9mm.
No mesmo período, 361 pessoas foram detidas ou encaminhadas à delegacia, resultando em 83 prisões, sendo 15 com mandados de prisão ativo. Também foi registrado o atendimento a 1.970 acidentes sem vítima e a 51 casos de roubo.
Um dos diferenciais do município é a Central de Vídeo Monitoramento Integrada, projeto desenvolvido pela Prefeitura de São José, com a parceria da Polícia Militar, Polícia Civil e Guarda Municipal de São José que funciona 24 horas monitorando as imagens transmitidas pelas 250 câmeras espalhadas por toda São José.
